Низкая экспрессия генов ST6GAL2 и CD248 как неблагоприятный прогностический маркер плоскоклеточной карциномы полости рта

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

   Введение. Плоскоклеточная карцинома полости рта (ПКПР) является агрессивным и быстропрогрессирующим заболеванием. Склонность к прогрессированию опухолевого процесса обусловлена клинико-патологическими характеристиками больного и биологическими особенностями опухоли. Большую роль в прогрессии опухоли имеют молекулярно-генетические нарушения, отражающиеся на транскриптомном уровне, что может быть использовано в прогнозе исхода заболевания.

   Цель исследования – выявить маркеры для оценки риска прогрессирования ПКПР.

   Материалы и методы. На основании данных базы «Атлас ракового генома» (The Cancer genome Atlas, TCGA) проведен биоинформатический поиск генов, ассоциированных с прогрессией ПКПР (отобраны 11 генов). Затем выполнен ретроспективный анализ клинических данных и гистологического материала 38 больных ПКПР, проходивших лечение в Научно-исследовательском институте онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук» с 2018 по 2021 гг. Исследовались фиксированные образцы опухолевой ткани. Уровень экспрессии генов определялся методом количественной полимеразной цепной реакции в режиме реального времени.

   Результаты. Показано, что снижение уровня матричной РНК ST6GAL2 связано с наличием лимфогенных метастазов, а уменьшение уровня матричной РНК CD248 – с возникновением рецидивов.

   Заключение. Уровень экспрессии генов ST6GAL2 и CD248 может использоваться в качестве предикторов неблагоприятного прогноза ПКПР.

Об авторах

И. К. Федорова

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Автор, ответственный за переписку.
Email: irina_fedorova96@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7540-8532

Ирина Казановна Федорова

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

Е. С. Колегова

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-9122-3274

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

Е. А. Простакишина

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-1405-3723

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

Т. Д. Дампилова

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-8770-3117

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

М. Р. Патышева

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-2865-7576

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

П. С. Ямщиков

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-0646-6093

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

Е. В. Денисов

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-2923-9755

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

Е. Л. Чойнзонов

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-3651-0665

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

Д. Е. Кульбакин

Научно-исследовательский институт онкологии ФГБНУ «Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук»

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-3089-5047

634009; пер. Кооперативный, 5; Томск

Россия

Список литературы

  1. Wu K., Jiang Y., Zhou W. et al. Long noncoding RNA RC3H2 facilitates cell proliferation and invasion by targeting microRNA-101-3p/EZH2 axis in OSCC. Mol Ther Nucleic Acids 2020;20: 97–110. doi: 10.1016/j.omtn.2020.02.006
  2. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I. et al. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin 2018;68(6): 394–424. doi: 10.3322/caac.21492
  3. Zanoni D.K., Montero P.H., Migliacci J.C. et al. Survival outcomes after treatment of cancer of the oral cavity (1985–2015). Oral Oncol 2019;90:115–21. doi: 10.1016/j.oraloncology.2019.02.001
  4. Weckx A., Riekert M., Grandoch A. et al. Time to recurrence and patient survival in recurrent oral squamous cell carcinoma. Oral Oncol 2019;94:8–13. doi: 10.1016/j.oraloncology.2019.05.002
  5. Safi A.F., Kauke M., Grandoch A. et al. Analysis of clinicopathological risk factors for locoregional recurrence of oral squamous cell carcinoma – retrospective analysis of 517 patients. J Craniomaxillofac Surg 2017;45(10):1749–53. doi: 10.1016/j.jcms.2017.07.012
  6. Bugshan A., Farooq I. Oral squamous cell carcinoma: metastasis, potentially associated malignant disorders, etiology and recent advancements in diagnosis. F1000Res 2020;9:229. doi: 10.12688/f1000research.22941.1
  7. Kleverov M., Zenkova D., Kamenev V. et al. Phantasus: web-application for visual and interactive gene expression analysis. BioRxiv 2022;12. doi: 10.1101/2022.12.10.519861
  8. Arriaga J.M., Bravo A.I., Mordoh J., Bianchini M. Metallothionein 1G promotes the differentiation of HT-29 human colorectal cancer cells. Oncol Rep 2017;37(5):2633–51. doi: 10.3892/or.2017.5547
  9. Zhang M., Chai Y.D., Brumbaugh J. et al. Oral cancer cells may rewire alternative metabolic pathways to survive from siRNA silencing of metabolic enzymes. BMC Cancer 2014;14:223. doi: 10.1186/1471-2407-14-223
  10. Kontsekova S., Polcicova K., Takacova M., Pastorekova S. Endosialin: molecular and functional links to tumor angiogenesis. Neoplasma 2016;63(2):183–92. doi: 10.4149/202_15090N474
  11. Rettig W.J., Garin-Chesa P., Healey J.H. et al. Identification of endosialin, a cell surface glycoprotein of vascular endothelial cells in human cancer. Proc Natl Acad Sci USA 1992;89(22):10832–6. doi: 10.1073/pnas.89.22.10832
  12. St Croix B., Rago C., Velculescu V. et al. Genes expressed in human tumor endothelium. Science 2000;289(5482):1197–202. doi: 10.1126/science.289.5482.1197
  13. Zhao X.T., Zhu Y., Zhou J.F. et al. Development of a novel 7 immune-related genes prognostic model for oral cancer: A study based on TCGA database. Oral Oncol 2021;112:105088. doi: 10.1016/j.oraloncology.2020.105088
  14. Hedlund M., Ng E., Varki A., Varki NM. Alpha 2-6-Linked sialic acids on N-glycans modulate carcinoma differentiation in vivo. Cancer Res 2008;68(2):388–94. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-07-1340
  15. Nakano M., Saldanha R., Göbel A. et al. Identification of glycan structure alterations on cell membrane proteins in desoxyepothilone B resistant leukemia cells. Mol Cell Proteomics 2011;10(11):M111.009001. doi: 10.1074/mcp.M111.009001
  16. Liang L., Xu J., Wang M. et al. LncRNA HCP5 promotes follicular thyroid carcinoma progression via miRNAs sponge. Cell Death Dis 2018;9(3):372. doi: 10.1038/s41419-018-0382-7
  17. Agrawal P., Fontanals-Cirera B., Sokolova E. et al. A systems biology approach identifies FUT8 as a driver of melanoma metastasis. Cancer Cell 2017;31(6):804–19.e7. doi: 10.1016/j.ccell.2017.05.007
  18. Wu T., Jiao Z., Li Y. et al. HPRT1 Promotes chemoresistance in oral squamous cell carcinoma via activating MMP1/PI3K/Akt signaling pathway. Cancers (Basel) 2022;14(4):855. doi: 10.3390/cancers14040855
  19. Ye H., Zheng Z., Song Y. et al. Metabolism-related bioinformatics analysis reveals that HPRT1 Facilitates the progression of oral squamous cell carcinoma in vitro. J Oncol 2022;2022:7453185. doi: 10.1155/2022/7453185
  20. Guo Q., Zhang Q., Lu L., Xu Y. Long noncoding RNA RUSC1-AS1 promotes tumorigenesis in cervical cancer by acting as a competing endogenous RNA of microRNA-744 and conse-quently increasing Bcl-2 expression. Cell Cycle 2020;19(10):1222–35. doi: 10.1080/15384101.2020.1749468
  21. Zou D., Lou J., Ke J. et al. Integrative expression quantitative trait locus-based analysis of colorectal cancer identified a functional polymorphism regulating SLC22A5 expression. Eur J Cancer 2018;93:1–9. doi: 10.1016/j.ejca.2018.01.065
  22. Yang Y., Wu J., Yu X. et al. SLC34A2 promotes cancer proliferation and cell cycle progression by targeting TMPRSS3 in colorectal cancer. Pathol Res Pract 2022;229:153706. doi: 10.1016/j.prp.2021.153706
  23. Zhang H.X., Liu O.S., Deng C. et al. Genome-wide gene expression profiling of tongue squamous cell carcinoma by RNA-seq. Clin Oral Investig 2018;22(1):209–16. doi: 10.1007/s00784-017-2101-7
  24. Almhöjd U., Cevik-Aras H., Karlsson N. et al. Stimulated saliva composition in patients with cancer of the head and neck region. BMC Oral Health 2021;21(1):509. doi: 10.1186/s12903-021-01872-x
  25. Ghantous Y., Bahouth Z., Abu El-Naaj I. Clinical and genetic signatures of local recurrence in oral squamous cell carcinoma. Arch Oral Biol 2018;95:141–8. doi: 10.1016/j.archoralbio.2018.07.018
  26. Jadhav K.B., Gupta N. Clinicopathological prognostic implicators of oral squamous cell carcinoma: need to understand and revise. N Am J Med Sci 2013;5(12):671–9. URL: https://www.researchgate.net/publication/259632012_Clinicopathological_Prognostic_Implicators_of_Oral_Squamous_Cell_Carcinoma_Need_to_Understand_and_Revise
  27. Milflores-Flores L., Millán-Pérez L., Santos-López G. et al. Characterization of P1 promoter activity of the beta-galactoside alpha2,6-sialyltransferase I gene (siat 1) in cervical and hepatic cancer cell lines. J Biosci 2012;37(2):259–67. doi: 10.1007/s12038-012-9194-6
  28. McGreal E.P., Ikewaki N., Akatsu H. et al. Human C1qRp is identical with CD93 and the mNI-11 antigen but does not bind C1q. J Immunol 2002;168(10):5222–32. doi: 10.4049/jimmunol.168.10.5222

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© , 2023


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 36990 от  21.07.2009.